多形性腺瘤（pleiomorphic adenoma）诊断的要点：境界清楚、两种细胞成分（上皮和肌上皮） 、肌上皮溶解现象、软骨样基质、浆细胞样细胞。 在多形性腺瘤中，PLAG1可与CTNNB1、LIFR、TCEA1、CHCHD7等基因发生融合，总发生率约40%，可辅助多形性腺瘤与良性肿瘤相鉴别。

脂肪母细胞瘤（lipoblastoma） 中的重现性融合基因异常有PLAG1-COL1A2、 PLAG1-COL3A1、PLAG1-HAS2、PLAG1-RAB2A、PLAG1-RAD51B等。 PLAG1基因断裂可用于辅助诊断脂肪母细胞瘤。