在HER2基因扩增的患者中长伴随着TOP2A基因扩增（约30%~50%），TOP2A基因扩增占全部乳腺癌的8%，且预后差。 TOP2A基因扩增的乳腺癌患者使用CEF方案治疗可降低复发和死亡风险，是蒽环类药物的作用靶标。 TOP2A基因缺失的患者预后更差，且不宜使用蒽环类药物治疗。 HER2和TOP2A共扩增的患者单用蒽环类药物方案（AC，环磷酰胺+多柔比星）的疗效（无病生存期和总生存期）与AC+赫塞汀的相当（2011年3000例BCIRG 006临床数据）。 蒽环类药物用药前进行靶标人群筛选可降低其带来的心脏毒性和诱发继发性白血病等副作用。