13q缺失是CLL最常见的染色体异常，40%-60%的CLL出现该异常。单纯del(13q14)常于BinetA期时出现，预后较好，或与正常核型患者相似；中位生存期133个月，无治疗生存期最长达92个月。若伴有+12、11q-等其它染色体异常，则预后通常较差。11q-是CLL另外一个预后较差的核型异常，常规核型分析检出率<5%，而应用FISH可以提高到20%。ATM缺失的发生率为12%-20%，一些患者即便在初诊时没有ATM缺失，但随着疾病进展，可出现ATM的缺失，提示ATM的缺失与CLL进展密切相关。