13q缺失（RB1位于此位点）是CLL最常见的染色体异常，40%-60%的CLL出现该异常，单纯 del(13q14)常于 BinetA 期时出现，预后较好，或与正常核型患者相似；中位生存期(MS)133 个月，无治疗生存期(TFS)最长达 92 个月。若伴有+12、11q-等其它染色体异常，则预后通常较差。ATM 缺失的发生率为 12%-20%，一些患者即便在初诊时没有 ATM 缺失，但随着疾病进展，可出现 ATM 的缺失，提示 ATM 的缺失与 CLL 进展密切相关。 P53缺失在B-CLL中发生率约为17%；该类患者对于传统单药化疗效果较差，生存期较短。 对于具有del（17p）的CLL患者对于含有阿伦单抗（anti-cd52）的治疗方案较为敏感。 对于经过FISH检测不具有del（17p）和del（11q）的CLL患者推荐进行传统化疗±免疫治疗。

IGH基因断裂及易位类型复杂，涉及多种基因，常见于ALL/MM/淋巴瘤。 可用于检测IGH基因是否出现异常及微小残留病灶检测。 IGH基因断裂可作为骨髓瘤细胞恶性克隆的标志，不受临床分期和免疫类型的影响，可作为确诊MM的有利依据之一。 P53缺失在新发MM中有1/3的发生率。