约有3/4的儿童前驱B细胞ALL（BCP-ALL）患者已鉴定出与临床相关的染色体异常，如超二倍体、低二倍体、t（12；21）、t（1；19）、t（9；22）、MLL易位等。这些靶标在危险度分层及治疗中发挥着重要作用。 其他的BCP-ALL患者的发病机制及驱动基因尚未充分了解，称为“BothersALL”； MEF2D,ZNF384和DUX4为“BothersALL”新鉴定出来的新的融合基因亚型。