在儿童期前体B-ALL中，出现高频率的跨系TCR基因重排：分别发现35％、60％和90％的病例有TCRB、TCRG和TCRD的基因重排和（或）缺失。在前体B-ALL中，跨系TCR基因重排的范围非常有限。TCRB基因重排限制在Jβ2区。这与正常的T细胞和T-ALL在Jβ1和Jβ2基因区都有发生的有所不同。在T-ALL中，所有的TCRγδ+ T-ALL有TCRG和TCRD的基因重排，而且绝大多数（约95％）还包含TCRB基因重排。